Ziel der MHL ist, ideale Rahmenbedingungen für ein effizientes Musikstudium zu schaffen. Alle Hochschulmitglieder richten ihr Tun darauf aus, um den Studierenden das bestmögliche Rüstzeug zu einem erfolgreichen Musikberuf an die Hand zu geben.
An der Spitze der MHL steht das Präsidium, ein vierköpfiges unabhängiges Gremium, das aus dem Präsidenten, zwei Vizepräsidenten und dem Kanzler besteht. Die Präsidiumsmitglieder werden vom Senat gewählt. Sie widmen sich unterschiedlichen Geschäftsbereichen und verantworten als Ganzes alle hochschulrelevanten Belange.
Das Präsidium wird von einer effizienten Verwaltung unterstützt, die in verschiedenen Sachgebieten aufgeteilt die vielfältigen Aufgaben eines Hochschulbetriebs umsetzt.